Per ottimizzare l'introduzione dell'amministrazione online, secondo la Commissione Europea è necessario disporre di alcuni strumenti chiave, quali:
 

• Sistemi interoperabili di gestione dell'identificazione elettronica (eIDM - Electronic Identity Management) per l'accesso ai servizi pubblici;
• Autenticazione elettronica dei documenti;
• Archiviazione elettronica.

 
Gli Stati membri hanno convenuto di istituire, entro il 2010, sistemi protetti di riconoscimento reciproco dei mezzi di identificazione elettronica nazionali per i siti Internet e i servizi delle Amministrazioni Pubbliche.
La Commissione intende definire specifiche comuni per la gestione dei mezzi di identificazione elettronica e sorvegliare i progetti pilota di sistemi eIDM su vasta scala, proponendo un approccio pragmatico all'interoperabilità dei vari sistemi eIDM,  finalizzato a rispettare le differenti strategie e soluzioni nazionali senza creare ostacoli all'utilizzo transfrontaliero dei servizi pubblici.
L' eIDM, che include il documento digitale, l'autenticazione e l'archiviazione sono fondamentali per un forte impatto di servizi forniti tra le amministrazioni e dalle amministrazioni ai cittadini e alle imprese, tra i Paesi dell'Unione Europea. La sicurezza dell'identità elettronica e dell'eSignature (che opera in tutta Europa e al di fuori) permetterà ai singoli individui e alle imprese di svolgere online più attività in maniera più significativa.
 
Il percorso dell'Unione Europea per promuovere il riconoscimento reciproco delle eSignature e una maggiore interoperabilità tra diversi sistemi di eIDM è fondamentale per raggiungere un tale impulso economico per il mercato unico. (A road map for a pan-European eIDM framework by 2010).
 
Le Amministrazioni Pubbliche stanno introducendo sempre nuove e più complesse tecnologie dell'informazione e della comunicazione per gestire i loro processi, ma un efficace eGovernment richiede loro di lavorare insieme senza problemi. Il problema principale per questo obiettivo è l'interoperabilità: alcuni sistemi interagiscono a vicenda abbastanza bene, altri non riescono a comunicare.
Queste difficoltà di comunicazione dipendono da una varietà di norme tecniche ed organizzative, che possono o non essere compatibili.
Il Quadro Europeo dell'Interoperabilità cerca di affrontare i problemi di comunicazione le incoerenze tra i servizi, le regioni e paesi dell'UE in modo tale che servizi paneuropei di governo elettronico possano diventare veramente interoperabili.
 
Importanti servizi di eGovernment devono contare su importanti investimenti in sistemi software, con la maggior parte delle amministrazioni che optano per un software proprietario. Anche se si tratta per la maggior parte dei sistemi più diffusi, il loro grande svantaggio è che lo sviluppatore limiti il cliente nell'utilizzo del software senza la libertà di cambiare fornitore. Con l'Open Source Software (OSS), dall'altro lato, il codice che costituisce il programma è aperto, per cui qualsiasi sviluppatore di software è in grado di lavorare su di esso. Con il cambiare delle esigenze degli utenti, il software può essere aggiornato e adattato da qualsiasi sviluppatore. Le licenze per l'uso OSS sono molto meno restrittive, il che lo rende più economico.